Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PrkcqQ02111 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PrkcqQ02111 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PrkcqQ02111 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PrkcqQ02111 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcqQ02111 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PrkcqQ02111 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PrkcqQ02111 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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