Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snai1Q02085 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms