Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Col1a2Q01149 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Col1a2Q01149 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms