Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde1bQ01065 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms