Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scn1bP97952 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Scn1bP97952 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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