Protein–RNA interactions for Protein: P97798

Neo1, Neogenin, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neo1P97798 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neo1P97798 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neo1P97798 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Neo1P97798 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neo1P97798 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Neo1P97798 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms