Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms