Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tarbp2P97473 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tarbp2P97473 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms