Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms