Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms