Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Arf1P84078 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms