Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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