Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabpb2P81069 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms