Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irx1P81068 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms