Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx2P81066 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx2P81066 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx2P81066 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Irx2P81066 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx2P81066 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx2P81066 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx2P81066 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx2P81066 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx2P81066 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx2P81066 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx2P81066 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Irx2P81066 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irx2P81066 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irx2P81066 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx2P81066 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms