Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms