Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54lP70270 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54lP70270 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms