Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcbP68404 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms