Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb4bP68372 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tubb4bP68372 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms