Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tuba4aP68368 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tuba4aP68368 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tuba4aP68368 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tuba4aP68368 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tuba4aP68368 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tuba4aP68368 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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