Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp46P62069 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp46P62069 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp46P62069 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp46P62069 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp46P62069 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp46P62069 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp46P62069 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp46P62069 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp46P62069 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usp46P62069 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp46P62069 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp46P62069 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms