Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn18P56857 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn18P56857 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms