Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NrlP54846 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NrlP54846 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NrlP54846 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NrlP54846 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NrlP54846 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NrlP54846 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NrlP54846 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NrlP54846 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NrlP54846 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NrlP54846 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NrlP54846 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NrlP54846 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NrlP54846 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NrlP54846 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NrlP54846 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms