Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacnb3P54285 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacnb3P54285 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacnb3P54285 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacnb3P54285 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacnb3P54285 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacnb3P54285 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacnb3P54285 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacnb3P54285 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacnb3P54285 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacnb3P54285 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacnb3P54285 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacnb3P54285 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacnb3P54285 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms