Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RabggtbP53612 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms