Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psen1P49769 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms