Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cox8bP48772 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms