Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
VdrP48281 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VdrP48281 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VdrP48281 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VdrP48281 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VdrP48281 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VdrP48281 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VdrP48281 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VdrP48281 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VdrP48281 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VdrP48281 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VdrP48281 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VdrP48281 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VdrP48281 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VdrP48281 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VdrP48281 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VdrP48281 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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