Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gbx2P48031 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gbx2P48031 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gbx2P48031 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gbx2P48031 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gbx2P48031 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gbx2P48031 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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