Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtprkP35822 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprkP35822 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms