Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ptpn11P35235 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms