Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp4P35123 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp4P35123 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.6 ms