Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc10P31257 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms