Protein–RNA interactions for Protein: P31240

Pdgfb, Platelet-derived growth factor subunit B, mousemouse

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Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfbP31240 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfbP31240 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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