Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Hoxd10P28359 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Hoxd10P28359 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Hoxd10P28359 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Hoxd10P28359 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Hoxd10P28359 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd10P28359 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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