Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb1P28230 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms