Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnna1P26231 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms