Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo2P25801 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms