Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsta3P23591 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms