Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pde6bP23440 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pde6bP23440 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pde6bP23440 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pde6bP23440 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pde6bP23440 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pde6bP23440 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pde6bP23440 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pde6bP23440 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pde6bP23440 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pde6bP23440 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pde6bP23440 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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