Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a2P20490 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms