Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PrkcaP20444 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms