Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ntf3P20181 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms