Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P20040 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P20040 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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