Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NefhP19246 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NefhP19246 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NefhP19246 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NefhP19246 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NefhP19246 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NefhP19246 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NefhP19246 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NefhP19246 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NefhP19246 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NefhP19246 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NefhP19246 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NefhP19246 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms