Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms