Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PcnaP17918 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PcnaP17918 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms