Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb2P13373 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms