Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt8P11679 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt8P11679 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms