Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Myod1P10085 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms